Direktino preslikavanje simboličke sekvence u frekvencijsko područje

Jelovina, Denis (2011) Direktino preslikavanje simboličke sekvence u frekvencijsko područje. Diploma thesis, Faculty of Science > Department of Physics.

[img] PDF
Restricted to Registered users only
Language: Croatian

Download (1MB)

Abstract

Ovaj rad se nadovezuje na dosadašnji rad grupe sa Fizičkog odsjeka pod vodstvom prof. dr. sc. Vladimira Paara. Pri traženju korelacija unutar genoma primjenjuje se pristup identificiranja tzv. repeticija kao što je objašnjeno u kasnijim poglavljima. Posebna pažnja je posvećena tandemnim repeticijama za koje se zna da utječu na neke genetski vezane bolesti (npr. [3, 4, 5]). Obrada velike količine podataka, kao što je genom višeg organizma, je gotovo nemoguća bez računala. Dosad najbolji algoritam za ovakvu vrstu problema [3] koristi statističke metode i zahtjeva zadavanje nemalog broja parametara. To uvelike ograničava brzinu i područje traženja repeticija. Cilj ovog rada bi se ukratko mogao sažeti na: traženje efikasnije metode za identificiranje repeticija, posebno tandemnih. Vodeno je računa da broj parametara koje treba zadati i brzina izračuna budu minimalni, istovremeno zadržavajući što kompletniji set izlaznih rezultata. Kako su ovakvi algoritmi frekventno korišteni pri utvrdivanju pravilnosti u genomu, dodatni uvjet je njihova izvedivost na današnjim osobnim računalima.

Item Type: Thesis (Diploma thesis)
Keywords: simboličke sekvence, frekvencijsko područje
Supervisor: Paar, Vladimir
Date: 28 October 2011
Number of Pages: 0
Subjects: NATURAL SCIENCES > Physics
Divisions: Faculty of Science > Department of Physics
Depositing User: Gordana Stubičan Ladešić
Date Deposited: 04 Jan 2014 22:54
Last Modified: 20 Jan 2017 14:28
URI: http://digre.pmf.unizg.hr/id/eprint/151

Actions (login required)

View Item View Item

Nema podataka za dohvacanje citata