Utjecaj kratkih tandemskih repeticija na GRM dijagrame egzona

Kosmina, Domagoj (2012) Utjecaj kratkih tandemskih repeticija na GRM dijagrame egzona. Diploma thesis, Faculty of Science > Department of Physics.

[img] PDF
Restricted to Registered users only
Language: Croatian

Download (4MB)

Abstract

Genetska sekvenca zadnjeg ljudskog kromosoma objavljena je prije godinu dana i tako je završilo jedno veliko poglavlje projekta ljudskog genoma. Iako je skoro sveukupna genomska sekvenca objavljena, mehanizam ekspresije gena, nasljednosti, međudjelovanja je razmjerno nepoznat. Za velike dijelove DNK ne zna se što rade, ako uopće imaju funkciju. Otkrivanje točnih mehanizma koji prevode molekulu DNK u živi organizam, te razna međudjelovanja gena i drugih dijelova DNK važni su za daljnje razvijanje medicine, genetike i biotehnologije. Danas, znanstvenici iz cijelog svijeta mogu pristupiti genetskim sekvencama raznih organizama, i podvrgnuti ih svojim analizama. Iako se ljudskim genomom bavi veliki broj ljudi, rezultati analiza su nam tek na početku otkrivanje funkcionalnosti DNK. Sam ljudski genom sadrži 3.2 Gb podataka, a o kompleksnosti cijelog sustava govori nam da promjena i jednog nukleotida na jednom mjestu može uzrokovati bolesti i ozbiljne genetske poremećaje. S tim na umu javlja se problem obrade podataka. Uz tako veliku količinu informacija postavlja se pitanje kako obraditi i prezentirati istraživanje na način da se bitne informacije ne gube među mnoštvom, te da su bitne informacije vidljive i usporedive. Tandemske repeticije pokazuju svojstva regulacije gena i ostatka DNK, te je zato zanimljivo pristupiti molekuli DNK na taj način. Pomoću GRM algoritma možemo na efikasan i brz način tražiti tandemske repeticije u genomu bez da gubimo informaciju tako da simboličke vrijednosti iz DNK prevodimo u numeričke parametre. U ovom radu analizirati ću kratke tandemske repeticije (2 do 5 baznih parova) u egzonskom dijelu 1. ljudskog kromosoma. Uporabom fizikalnih statističkih metoda, pokazati ću kako tandemske repeticije ulogu u regulaciji gena, te njihovu ulogu u evolucijskom procesu.

Item Type: Thesis (Diploma thesis)
Keywords: genetika ; tandemska repeticija ; GRM analiza ljudskog kormosoma 1 ; Fourierova analiza
Supervisor: Paar, Vladimir
Date: 6 September 2012
Number of Pages: 41
Subjects: NATURAL SCIENCES > Physics
Divisions: Faculty of Science > Department of Physics
Depositing User: Gordana Stubičan Ladešić
Date Deposited: 19 Jan 2014 14:35
Last Modified: 19 Oct 2015 12:29
URI: http://digre.pmf.unizg.hr/id/eprint/215

Actions (login required)

View Item View Item

Nema podataka za dohvacanje citata