Role of the C-terminal domain of RNA-polymerase

Dunđer, Snježana (2016) Role of the C-terminal domain of RNA-polymerase. Bachelor's thesis, Faculty of Science > Department of Chemistry.

[img]
Preview
PDF
Language: Croatian

Download (749kB) | Preview

Abstract

RNA-polimeraza II je enzim koji katalizira nastajanje mRNA. Razlikuje se od ostalih eukariotskih RNA-polimeraza jer u svojoj strukturi sadrži posebnu C-terminalnu domenu (CTD) koja sudjeluje u regulaciji aktivnosti ovoga enzima. C-terminalna domena sadrži ponavljajući slijed od sedam aminokiselina YSPTSPS, a koliko puta će doći do ponavljanja i supstitucija aminokiselina u originalnom slijedu nekim drugim aminokiselinama, ovisi o složenosti organizma. CTD je dinamična, neuređena struktura, sposobna zauzeti različite konformacije uslijed interakcije njenih aminokiselinskih ostataka s okolinom. Stabilizira se vodikovim vezama, van der Waalsovim i elektrostatskim interakcijama, te zauzimanjem najpovoljnije konformacije ovisno od okoline u kojoj se nalazi. Njene funkcije određene su fosforilacijom i defosforilacijom aminokiselina koje se nalaze u ponavljajućem slijedu, a te procese kataliziraju razne kinaze i fosfataze. Ima važnu ulogu u inicijaciji transkripcije jer veže razne proteine, transkripcijske faktore i pomaže u nastajanju preinicijacijskog kompleksa. Tijekom inicijacije se fosforilira kako bi RNA-polimeraza mogla ući u elongacijsku fazu transkripcije. Tijekom i nakon transkripcije dolazi do prekrajanja, procesiranja i nastajanja 5'- kape na primarnim transkriptima. CTD i ovdje ima važnu ulogu, interagirajući i vežući se na važne faktore koji sudjeluju u tim procesima. U ovom radu će, stoga, biti fokus na tome koja je točno uloga CTD u navedenim procesima i na koji način C-terminalna domena sudjeluje u regulaciji aktivnosti RNA-polimeraze II.

Item Type: Thesis (Bachelor's thesis)
Keywords: polimeraze
Supervisor: Rokov Plavec, Jasmina
Date: 2016
Number of Pages: 20
Subjects: NATURAL SCIENCES > Chemistry
Divisions: Faculty of Science > Department of Chemistry
Depositing User: Branka Maravic
Date Deposited: 28 Sep 2016 07:31
Last Modified: 28 Sep 2016 07:31
URI: http://digre.pmf.unizg.hr/id/eprint/5116

Actions (login required)

View Item View Item